对于孤独症儿童的治疗，应做到早发现，早诊断，早干预。由于国内对孤独症认识较晚，国外很早开展的早期干预在我国才刚刚起步。早期干预是一种有目的、有系统、有组织的教育措施，能使6岁以前发现的孤独症儿童恢复正常或接近正常，使其智力、社交能力、语言表达能力、生活自理能力等得到不同程度的提高，部分儿童可在学前期进入正常学校学习。

早期干预的主要范围是儿童的五大行为领域。在运动方面，包括大运动和精细动作，如双脚同时跳、拍球、串球等，可促进大脑的发育，增强儿童的手眼协调性。在语言方面，包括语言理解、发音和表达。在认知方面，包括视觉认知，如辨别颜色;听觉认知，如辨别声音;触觉认知，如感受冷热;对数的理解。在生活自理方面，包括训练他们洗脸、刷牙、穿衣等基本的独立生活能力。在社会交际方面，鼓励他们参与集体活动，集体游戏，纠正与他人交往中不恰当的表达方式：如吐口水、怪叫等;进行社会交往的培养，使其与外界沟通，回归社会。

心理治疗法(Psychotherapeutic Approaches to Treatment)

在早期，由于心因论学说盛行，因此也直接影响到自闭症儿童及其家长所接受之治疗;在此时期，无论是直接针对儿童或间接针对家长，最普遍之治疗方法均为心理治疗法。但是此法并没有后续相关的研究支持其理论。

医药疗法(Physical Approaches to Treatment)

由于受到主张自闭症和精神分裂症有关学说之影响，使得曾有一段时间，治疗精神分裂症之疗法也常被应用在自闭症患者的治疗上，因此一些治疗精神分裂之药物，也被用在自闭症之治疗。但是由于自闭症与精神分裂症有很大的差异，加上难有一种药物能有效的对自闭症患者所有的症状有相当的疗效，因此在医药疗法上主要是处理自闭症患者的一些生理问题(如癫痫)、行为问题(如过动)之控制，或经由遗传谘商防范自闭症之发生等方面。此外，也有研究指出，药物的治疗可以视为自闭症整体疗育的一环，经由评估、用药分析、诊断及多元之效果评量，对某些自闭症患者而言，药物疗法也可算是安全的疗法之一。

教育疗法

在一九六O年代末期及一九七O年代初期，由于自闭症不再只被视为精神分裂的一种或是肇因于心理社会方面的因素，因此自闭症的疗育也有重大改变。取而代之的是重视有助自闭症社会人际，语言能力，及认知功能方面发展的方法。

在教育界，开始强调自闭症适性教育之重要，在学校设施方面，亦扩大因应而涵盖学前教育，通学或住校、毕业后之辅导措施，许多学者研究皆显示，自闭症儿童接受教育时间之长短和其日后之发展有很大的相关，而结构化教学之效果远优于放任式教学法。

行为治疗法

适当教育设施渐受重视的同时，以行为学说为基础之治疗方式亦开始发展，到了一九六O年代中期，制约理论已经广泛的被运用在多种儿童问题的治疗上，而自闭症儿童经由行为治疗的隔离、消弱、惩罚、差别增强等方法而改善不当的行为，包括自伤、自我刺激、过动、攻击行为等。后来操作制约技巧开始运用在自闭症患者其它能力的增进，如生活自理、职能训练等，甚至更进一步被运用在社会人际互动及语言沟通能力之训练上。虽然效果卓著，但仍有以下的问题需要考虑：

一、许多的治疗研究几乎都是个案的报告，无法有效的对照。

二、治疗进行多数只针对一项行为的特定变化，并未有长远、具体的影响考量。

三、很少考虑儿童在不同发展阶段的需要及个别的差异。

四、行为变化之评量多数在治疗场所进行，未考虑能否类化到非治疗的其它场所

五、长期的追踪辅导是相当需要的

其它疗法

尚有以下几种针对自闭症相关的特殊治疗获教育方面的技巧：

嫌恶治疗法、物理治疗法、舞蹈治疗法、发展治疗法、语言治疗法、游戏治疗法音乐治疗法、拥抱治疗法、互动治疗法、感觉统合、回归主流、非疗养院安置方式。